星期日, 八月 11, 2013

闭关前言

连锁分析我讲了很多遍。不可否认,在各地讲课过程中我受益良多。然而直到今天我才知道为什么功能基因突变为何这么容易定位,即便只有少数几个个 体,比如一个家系中的十几个乃至只有几个个体。它的过程是首先确定目标区域,其中可能有数十万的变异。其中包括:((编码和拼接的变异:(非同义突变,拼接变异,插入删除片段, 其它)),其它)。其中绿字部分才是可能包含致病因子,它们可能只占总变异数的 1/3 左右。之后我们要参考 HapMap 的结果,找出其中罕见的变异,或者说一般人中没有或不常有的变异。这样目标变异范围又可以缩至约 2%。然后再与自己所有的数据库比较,以及比较多个病人所共享的纯合子的变异。到以上最后一步,基本上就可以确定致病的 QTL。

这里有一个前提,那就是人类的致病基因通常来自功能突变。在动物生产中,我们通常要求那些增产的 QTL,它们通常不在功能基因区,其发现过程与前面所述不同。不管如何,通过以上步骤,人类遗传学中定位基因的效率比一般的连锁分析高很多个数量级,以上整个过程甚至可以跳过连锁分析的部分。由此也可以看出基因组计划、以及后来的 HapMap,Encode 等项目的重要性。如果对这些项目的内容不熟悉以及不能熟练掌握,那么作为我们这一行的科研工作者是不合格的。

由此我也想到,如果不能把所有可能的时间用来琢磨自己的工作的相关内容,作出高水平的研究是不可能的。

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